Sciences du vivant pour les biotechnologies
CEA
Jeudi 17 Novembre 2011
Le complexe XRCC4-Cernunnos faciliterait la réparation des cassures double brin de l’ADN par une super-structure en filaments
Une équipe de l'iBiTec-S a résolu la structure tridimensionnelle du complexe XRCC4-Cernunnos. La cristallographie couplée à des études de microscopie électronique révèle l’architecture des super-structures filamenteuses formées par ces deux facteurs de réparation de l’ADN et permet de proposer un nouveau modèle de ligation des cassures double brin.
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Le complexe XRCC4-Cernunnos faciliterait la réparation des cassures double brin de l’ADN par une super-structure en filaments
Une équipe de l'iBiTec-S a résolu la structure tridimensionnelle du complexe XRCC4-Cernunnos. La cristallographie couplée à des études de microscopie électronique révèle l’architecture des super-structures filamenteuses formées par ces deux facteurs de réparation de l’ADN et permet de proposer un nouveau modèle de ligation des cassures double brin.
Ropars V, et al., Proc Natl Acad Sci U S A. 108, 12663-12668.
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CEA
Mardi 11 Octobre 2011
Observation structurale d’une enzyme en action
Observer les enzymes en pleine action n’est pas simple. Pourtant, des chercheurs de l’Université de Pavie (Italie), de l’IBS, de l’ESRF et de l’Université de Groningen (Pays-Bas) ont réussi à générer et caractériser plusieurs états intermédiaires d’une enzyme : une mono-oxygénase de type Baeyer-Villiger. Cette enzyme est une cible intéressante pour des applications en chimie synthétique et pharmaceutique. Cette étude qui combine les techniques de cristallographie aux rayons-X et la micro-spectrophotométrie est publiée par la revue Journal of Biological Chemistry [1].
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Observation structurale d’une enzyme en action
Observer les enzymes en pleine action n’est pas simple. Pourtant, des chercheurs de l’Université de Pavie (Italie), de l’IBS, de l’ESRF et de l’Université de Groningen (Pays-Bas) ont réussi à générer et caractériser plusieurs états intermédiaires d’une enzyme : une mono-oxygénase de type Baeyer-Villiger. Cette enzyme est une cible intéressante pour des applications en chimie synthétique et pharmaceutique. Cette étude qui combine les techniques de cristallographie aux rayons-X et la micro-spectrophotométrie est publiée par la revue Journal of Biological Chemistry [1].
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CEA
Samedi 01 Octobre 2011
La spectroscopie par RMN à l'état solide donne accès à l’asymétrie des mouvements dans les protéines
Une équipe de l'IBS [1], en collaboration avec l'ETH de Zurich, a mis en place une nouvelle expérience par résonance magnétique nucléaire (RMN) du solide qui permet d'obtenir des informations bien plus précises sur l’amplitude et l’asymétrie des mouvements dans les protéines.
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La spectroscopie par RMN à l'état solide donne accès à l’asymétrie des mouvements dans les protéines
Une équipe de l'IBS [1], en collaboration avec l'ETH de Zurich, a mis en place une nouvelle expérience par résonance magnétique nucléaire (RMN) du solide qui permet d'obtenir des informations bien plus précises sur l’amplitude et l’asymétrie des mouvements dans les protéines.
Solid-State NMR Measurements of Asymmetric Dipolar Couplings Provide Insight into Protein Side-Chain Motion. Schanda P, Huber M, Boisbouvier J, Meier BH, Ernst M. Angew Chem Int Ed Engl. 2011.
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LPCV/iRTSV/DSV/CEA
Lundi 26 Septembre 2011
Une sonde moléculaire pour contrôler le métabolisme d’une plante
Des chercheurs du CEA [1], du CNRS, de l’Inra, et des Universités Joseph Fourier de Grenoble et Montpellier 2, ont mis au point une sonde moléculaire, la Galvestine-1, capable de contrôler de manière ultra-fine l’activité d’une enzyme chez la plante Arabidopsis thaliana. Cette enzyme, MGD1, est responsable de la synthèse des galactolipides, principaux constituants des membranes photosynthétiques. Grâce à cette méthode innovante de « génétique chimique », les scientifiques ont pu identifier le rôle des galactolipides dans le développement de la plante. Ce résultat vient de faire l’objet d’une publication en ligne dans la revue Nature Chemical Biology du 25 septembre 2011.
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Une sonde moléculaire pour contrôler le métabolisme d’une plante
Des chercheurs du CEA [1], du CNRS, de l’Inra, et des Universités Joseph Fourier de Grenoble et Montpellier 2, ont mis au point une sonde moléculaire, la Galvestine-1, capable de contrôler de manière ultra-fine l’activité d’une enzyme chez la plante Arabidopsis thaliana. Cette enzyme, MGD1, est responsable de la synthèse des galactolipides, principaux constituants des membranes photosynthétiques. Grâce à cette méthode innovante de « génétique chimique », les scientifiques ont pu identifier le rôle des galactolipides dans le développement de la plante. Ce résultat vient de faire l’objet d’une publication en ligne dans la revue Nature Chemical Biology du 25 septembre 2011.
Cyrille Y. Botté, et al., Chemical inhibitors of monogalactosyldiacylglycerol synthases in Arabidopsis thaliana, Nature Chemical Biology, online, Sep/25/2011.
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CEA
Vendredi 02 Septembre 2011
Les secrets d’adaptation de la « bactérie du désert »
Un consortium de chercheurs, notamment du CNRS, du CEA, de l’Inra et des Universités de la Méditerranée, de Paris-Sud, Toulouse et Grenoble 1, ont réalisé l’analyse du génome de la bactérie Ramlibacter tataouinensis TTB310, appelée aussi « bactérie du désert ». Le décryptage de son génome a révélé la présence du gène kaiC, un gène dont la fonction était jusqu’alors connue uniquement chez certaines bactéries photosynthétiques. Chez ces dernières, kaiC est responsable d’un mécanisme d’horloge moléculaire qui régule leur cycle cellulaire, en fonction du jour et de la nuit : on parle de rythme circadien endogène . Les résultats de cette étude suggèrent également que ce gène permettrait à la « bactérie du désert », non-photosynthétique, de caler son cycle cellulaire sur le cycle de l’eau dans les déserts chauds et secs. Cette découverte ouvre la voie à des recherches visant à comprendre le rôle des horloges moléculaires circadiennes dans l’adaptation des bactéries à leur environnement, qu’elles soient photosynthétiques ou non. Ces résultats sont publiés en ligne le 2 septembre par la revue PLoS ONE.
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Les secrets d’adaptation de la « bactérie du désert »
Un consortium de chercheurs, notamment du CNRS, du CEA, de l’Inra et des Universités de la Méditerranée, de Paris-Sud, Toulouse et Grenoble 1, ont réalisé l’analyse du génome de la bactérie Ramlibacter tataouinensis TTB310, appelée aussi « bactérie du désert ». Le décryptage de son génome a révélé la présence du gène kaiC, un gène dont la fonction était jusqu’alors connue uniquement chez certaines bactéries photosynthétiques. Chez ces dernières, kaiC est responsable d’un mécanisme d’horloge moléculaire qui régule leur cycle cellulaire, en fonction du jour et de la nuit : on parle de rythme circadien endogène . Les résultats de cette étude suggèrent également que ce gène permettrait à la « bactérie du désert », non-photosynthétique, de caler son cycle cellulaire sur le cycle de l’eau dans les déserts chauds et secs. Cette découverte ouvre la voie à des recherches visant à comprendre le rôle des horloges moléculaires circadiennes dans l’adaptation des bactéries à leur environnement, qu’elles soient photosynthétiques ou non. Ces résultats sont publiés en ligne le 2 septembre par la revue PLoS ONE.
The cyst-dividing bacterium Ramlibacter tataouinensis TTB310 genome reveals a well-stocked toolbox for adaptation to a desert environment. Gilles De Luca, Mohamed Barakat, Philippe Ortet, Sylvain Fochesato, Cécile Jourlin-Castelli, Mireille Ansaldi, Béatrice Py, Gwennaele Fichant, Pedro M. Coutinho, Romé Voulhoux, Olivier Bastien, Eric Maréchal, Bernard Henrissat, Yves Quentin, Philippe Noirot, Alain Filloux, Vincent Méjean, Michael S. DuBow, Frédéric Barras, Valérie Barbe, Jean Weissenbach, Irina Mihalcescu, André Verméglio, Wafa Achouak, Thierry Heulin, PLoS ONE, online, Sep/02/2011.
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CEA
Mardi 17 Mai 2011
L’ours des cavernes : des dessins de la Grotte Chauvet à l’extinction de l’espèce
L’ours des cavernes est abondamment représenté sur les parois de la Grotte Chauvet, située à l’entrée des Gorges de l’Ardèche. Depuis la découverte de la grotte, la datation de ses peintures suscite des interrogations voire une polémique au sein de la communauté scientifique. Dans ce contexte, Jean-Marc Elalouf et son équipe de l’iBiTec-S (CEA/Saclay) ont réussi à fournir une date minimale pour la réalisation d’une partie des chefs d’œuvre du sanctuaire ardéchois en précisant les caractéristiques de la population locale d’ours des cavernes et sa disparition il y a 27 000 ans.
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L’ours des cavernes : des dessins de la Grotte Chauvet à l’extinction de l’espèce
L’ours des cavernes est abondamment représenté sur les parois de la Grotte Chauvet, située à l’entrée des Gorges de l’Ardèche. Depuis la découverte de la grotte, la datation de ses peintures suscite des interrogations voire une polémique au sein de la communauté scientifique. Dans ce contexte, Jean-Marc Elalouf et son équipe de l’iBiTec-S (CEA/Saclay) ont réussi à fournir une date minimale pour la réalisation d’une partie des chefs d’œuvre du sanctuaire ardéchois en précisant les caractéristiques de la population locale d’ours des cavernes et sa disparition il y a 27 000 ans.
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CEA
Lundi 02 Mai 2011
Nano-objets biomimétiques : vers la maîtrise des assemblages
Des chercheurs du CEA , du CNRS et du laboratoire pharmaceutique Ipsen ont récemment montré, en utilisant le synchrotron SOLEIL, qu’il est possible de générer des nanotubes de peptides dont le diamètre est parfaitement contrôlé. Formés par assemblage spontané d’un peptide, le Lanréotide, ces nanotubes sont conditionnés par la structure de cette « brique de base ». En modifiant judicieusement l’un des acides aminés du Lanréotide, les chercheurs ont réussi à obtenir une gamme de 17 nanotubes parfaitement réguliers et de diamètres maîtrisés. Une première qui ouvre de nombreuses perspectives notamment dans la sphère des nanotechnologies. Ces travaux sont publiés en ligne dans la revue PNAS.
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Nano-objets biomimétiques : vers la maîtrise des assemblages
Des chercheurs du CEA , du CNRS et du laboratoire pharmaceutique Ipsen ont récemment montré, en utilisant le synchrotron SOLEIL, qu’il est possible de générer des nanotubes de peptides dont le diamètre est parfaitement contrôlé. Formés par assemblage spontané d’un peptide, le Lanréotide, ces nanotubes sont conditionnés par la structure de cette « brique de base ». En modifiant judicieusement l’un des acides aminés du Lanréotide, les chercheurs ont réussi à obtenir une gamme de 17 nanotubes parfaitement réguliers et de diamètres maîtrisés. Une première qui ouvre de nombreuses perspectives notamment dans la sphère des nanotechnologies. Ces travaux sont publiés en ligne dans la revue PNAS.
Christophe Tarabout, et al., Control of peptide nanotube diameter by chemical modifications of an aromatic residue involved in a single close contact, Proc Natl Acad Sci U S A, 2011.
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CEA
Jeudi 07 Avril 2011
Globules rouges ou cellules immunitaires : un équilibre sous le contrôle de la protéine TIF1γ
Des chercheurs de l’unité mixte [1] CEA/Inserm/Université Paris-Sud 11/Université Paris Diderot - Paris 7 viennent de montrer que la protéine TIF1γ joue un rôle essentiel dans le contrôle de l’hématopoïèse, ensemble des mécanismes qui assure le remplacement continu et régulé des différentes cellules sanguines. Au cours de l’hématopoïèse, deux protéines, TAL1 et PU.1, vont favoriser la fabrication des globules rouges et des plaquettes, pour l’une, et des cellules immunitaires, pour l’autre. Cependant le processus permettant, en fonction des besoins de l’organisme, le passage ou commutation [2] d’une voix de production à une autre restait un mystère. Un mystère désormais élucidé avec la publication en ligne par la revue Cell Stem Cell, le 7 avril, des travaux des chercheurs qui ont démontré le rôle de la protéine TIF1γdans cette commutation. Au-delà de leur intérêt fondamental ces résultats font de TIF1γ une cible potentielle pour induire la production sélective de ces différents types cellulaires dans les nombreuses situations pathologiques associées à leur altération, comme par exemple l’anémie ou l’aplasie.
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Globules rouges ou cellules immunitaires : un équilibre sous le contrôle de la protéine TIF1γ
Des chercheurs de l’unité mixte [1] CEA/Inserm/Université Paris-Sud 11/Université Paris Diderot - Paris 7 viennent de montrer que la protéine TIF1γ joue un rôle essentiel dans le contrôle de l’hématopoïèse, ensemble des mécanismes qui assure le remplacement continu et régulé des différentes cellules sanguines. Au cours de l’hématopoïèse, deux protéines, TAL1 et PU.1, vont favoriser la fabrication des globules rouges et des plaquettes, pour l’une, et des cellules immunitaires, pour l’autre. Cependant le processus permettant, en fonction des besoins de l’organisme, le passage ou commutation [2] d’une voix de production à une autre restait un mystère. Un mystère désormais élucidé avec la publication en ligne par la revue Cell Stem Cell, le 7 avril, des travaux des chercheurs qui ont démontré le rôle de la protéine TIF1γdans cette commutation. Au-delà de leur intérêt fondamental ces résultats font de TIF1γ une cible potentielle pour induire la production sélective de ces différents types cellulaires dans les nombreuses situations pathologiques associées à leur altération, comme par exemple l’anémie ou l’aplasie.
Sophie Kusy, et al., Adult hematopoiesis is regulated by TIF1, a repressor of TAL1 and PU.1 transcriptional activity. Cell Stem Cell, online, 2011
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CEA
Mardi 29 Mars 2011
Le Médiateur : un élément clé de la régulation de l’expression des gènes
Une équipe du CEA-iBiTec-S vient de résoudre l’une des questions fondamentales sur les mécanismes de l’expression des gènes : quel est l’acteur cellulaire responsable du positionnement sur l’ADN de l’enzyme clé de la transcription des gènes, l’ARN polymérase ? Ces chercheurs viennent en effet de montrer, in vivo, que c’est un complexe multiprotéique appelé « Médiateur de l’activation de la transcription» qui se charge de cette tâche.
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Le Médiateur : un élément clé de la régulation de l’expression des gènes
Une équipe du CEA-iBiTec-S vient de résoudre l’une des questions fondamentales sur les mécanismes de l’expression des gènes : quel est l’acteur cellulaire responsable du positionnement sur l’ADN de l’enzyme clé de la transcription des gènes, l’ARN polymérase ? Ces chercheurs viennent en effet de montrer, in vivo, que c’est un complexe multiprotéique appelé « Médiateur de l’activation de la transcription» qui se charge de cette tâche.
Direct interaction of RNA polymerase II and Mediator required for transcription in vivo. Julie Soutourina, Sandra Wydau, Yves Ambroise, Claire Boschiero and Michel Werner. Science, online, 18/03/2011
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CEA
Mardi 15 Mars 2011
Des nanomatériaux bio-inspirés pour les applications hydrogène
Des chercheurs du Laboratoire de chimie et biologie des métaux (DSV/iRTSV, CEA/Grenoble), en collaboration avec le Laboratoire de chimie des surfaces et interfaces (DSM/Iramis, CEA/Saclay) ont développé une nouvelle méthode pour immobiliser des catalyseurs bio-inspirés sur nanotubes de carbone et fabriquer des matériaux électrocatalytiques sans platine pour la production ou l’utilisation d’hydrogène.
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Des nanomatériaux bio-inspirés pour les applications hydrogène
Des chercheurs du Laboratoire de chimie et biologie des métaux (DSV/iRTSV, CEA/Grenoble), en collaboration avec le Laboratoire de chimie des surfaces et interfaces (DSM/Iramis, CEA/Saclay) ont développé une nouvelle méthode pour immobiliser des catalyseurs bio-inspirés sur nanotubes de carbone et fabriquer des matériaux électrocatalytiques sans platine pour la production ou l’utilisation d’hydrogène.
Tran PD, et al., Noncovalent modification of carbon nanotubes with pyrene-functionalized nickel complexes: carbon monoxide tolerant catalysts for hydrogen evolution and uptake. Angew Chem Int Ed Engl. 2011
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CEA
Mercredi 05 Janvier 2011
La réponse à des lumières changeantes chez les cyanobactéries
Comme les plantes, les cyanobactéries sont capables de convertir l’énergie lumineuse en énergie chimique et doivent se protéger d’un excès de lumière qui peut les tuer. Une équipe de l’iBiTec-S a découvert un mécanisme de photoprotection chez ces bactéries.
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La réponse à des lumières changeantes chez les cyanobactéries
Comme les plantes, les cyanobactéries sont capables de convertir l’énergie lumineuse en énergie chimique et doivent se protéger d’un excès de lumière qui peut les tuer. Une équipe de l’iBiTec-S a découvert un mécanisme de photoprotection chez ces bactéries.
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