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Actualités scientifiques

Lundi 15 Décembre 2008
L’ours des cavernes, une espèce éteinte dont le génome mitochondrial et la phylogénie sont dévoilés dans la Grotte Chauvet.

Un fragment osseux d’ours des cavernes de plus de 30 000 ans, provenant de la grotte Chauvet, fournit un génome mitochondrial complet pour cette espèce éteinte à la fin du Pléistocène.
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, (2008) 105, 17447-17452.
Lundi 15 Décembre 2008
Le transfert d’électron par sauts successifs le long d’un fil moléculaire de 15 Å composé de trois résidus tryptophane dans la photolyase de l’ADN se fait en 30 ps.

Des changements d’absorption anisotropiques ultra-rapides ont été exploités pour suivre le transfert d’électron entre des espèces (trois résidus tryptophane) qui sont chimiquement identique, mais se distinguent par leurs orientations dans la protéine.
J Am Chem Soc, (2008) 130, 14394-14395
Dimanche 14 Décembre 2008
Structure du complexe HSP90-SGT1 par RMN/modélisation et analyse fonctionnelle de la réponse immunitaire chez les plantes.

Une équipe du SB2SM, en collaboration avec le groupe de Ken Shirasu au Riken Plant Institute de Yokohama, vient de caractériser les détails moléculaires du complexe entre HSP90 et SGT1 en couplant des approches de RMN, de biochimie et de modélisation.
EMBO Rep (2008), 9(12):1209-1215
Dimanche 14 Décembre 2008
Quel est l’état d’association d’une protéine membranaire solubilisée : un protocole pour répondre à une question difficile.

Cet article décrit comment mesurer la quantité de détergents et de lipides liés à une protéine membranaire solubilisée et ensuite comment déterminer si cette protéine est monomérique, dimérique, etc... L'exemple donné est celui de la Ca2+ATPase du réticulum sarcoplasmique.
Nature Protocols,(2008) 3, 1782-1795
Dimanche 14 Décembre 2008
Le transfert photosynthétique d’électrons affecte la signalisation de H2O2 par l’inactivation de la catalase chez Chlamydomonas reinhardtii.

L’état d’oxydo-réduction de la chaîne photosynthétique de transfert d’électrons régule l’activité de la catalase et permet l’apparition de concentrations de peroxyde d’hydrogène (H2O2) assez élevée, celui-ci étant utilisé comme molécule de signalisation.
Planta (2008) 228 : 1055-1066.
Vendredi 14 Novembre 2008
Etude de l’initiation des origines de réplication chez les eucaryotes.

Un mécanisme stochastique non-linéaire pour l’initiation des origines de réplication.
PLoS ONE, (2008), 3, e2919.
Jeudi 13 Novembre 2008
Synthèse et caractérisation de nouveaux ligands puissants de l’ion uranyle.

Des ligands construits sur une plate-forme de type calix-arène présentent des propriétés de complexation exceptionnelles pour l’ion uranyle.
Tetrahedron, (2008), 64, 11319-11324.
Jeudi 13 Novembre 2008
La fréquence des réponses des lymphocytes T CD4 aux proteines Tat et Vpr du VIH résulte d’une répartition différente des épitopes T.

Le but de cet article est de comprendre comment la répartition des épitopes T CD4 dans une protéine contribue à la rendre immunogène pour de nombreux individus. Un seul épitope suffit pour la protéine Tat du VIH contrairement à Vpr.
Eur J Immunol, (2008), 38, 2821-31.
Mardi 14 Octobre 2008
Identification des sites d’interaction de la toxine MT7 vis-à-vis de deux états conformationnels du récepteur muscarinique hM1.

Ce papier décrit comment un ligand allostérique peptidique du récepteur hM1 interagit d’une part de façon spécifique sur ce récepteur et d’autre part différemment sur deux états conformationnels de celui-ci.
Mol Pharmacol, (2008), 74 (6): 1554-1563.
Mardi 14 Octobre 2008
Quand les ARN polymérases s’auto-régulent...

Embo J, (2008), 27, 2411-2421.
Lundi 15 Septembre 2008
Le Médiateur de l’activation de la transcription joue un rôle essentiel dans le recrutement du facteur général TFIIH.

L’obtention de mutants affectant l’interaction entre une sous-unité du Médiateur de l’activation de la transcription et ses partenaires a permis de déterminer un rôle pour ce coactivateur dans le recrutement de facteurs généraux de la transcription dans les complexes de préinitiation.
Mol Cell, (2008), 31, 337-346.
Lundi 15 Septembre 2008
Un nouveau photorécepteur qui perçoit l’excès d’intensité lumineuse et induit un mécanisme de photoprotection.

Cet article décrit un nouveau photorécepteur qui aide les organismes photosynthétiques à survivre sous une forte intensité lumineuse sans être « brulés » et il met en évidence un nouveau rôle biologique pour les caroténoïdes.
Proc Natl Acad Sci USA, (2008), 105, 12075-12080.
Vendredi 12 Septembre 2008
L’immunogénicité de l’antigène tumoral Survivine chez les sujets sains et atteints de cancer.

Cette étude évalue l’immunogénicité de l’antigène tumoral Survivine chez les sujets sains et atteints de cancer et définit les séquences immunogéniques contenues dans sa séquence.
J Immunol, (2008), 181, 431-439.
Vendredi 12 Septembre 2008
Optimisation par chimie combinatoire d'une miniprotéine, mime de CD4, et structures co-cristallographiques avec la protéine enveloppe gp120 du VIH-1.

Une équipe du SIMOPRO présente l'apport de la chimie combinatoire couplée à l'analyse structurale pour l'optimisation d'un mime de CD4, candidat présentant une activité microbicide anti-VIH.
J Mol Biol, (2008), 382, 510-24.
Lundi 21 Juillet 2008
Nano-sondes hybrides pour le ciblage «intelligent» de protéines

J Am Chem Soc, (2008), 130, 8596-8597.
Lundi 21 Juillet 2008
L’analyse de la localisation génomique révèle un nouveau rôle de TFIIS dans la transcription par l’ARN polymérase III

La localisation génomique du facteur de transcription TFIIS a permis de mettre en évidence, en plus de sa fonction bien connue dans la transcription par l’ARN polymérase II, un nouveau rôle que ce facteur joue dans la transcription par l’ARN polymérase III.
Genes & Dev, (2008), 22, 1934-47.
Dimanche 20 Juillet 2008
Assemblages métalliques hybrides sur nanotubes de carbone pour l’électrocatalyse.

J Am Chem Soc, (2008), 130, 8110-8111.
Dimanche 20 Juillet 2008
Association des matrices d’auto-corrélation à la spectrométrie de masse à ultra-haute résolution pour l’identification des signaux discriminants en analyse métabolomique.

Une stratégie reposant sur l’utilisation conjointe de matrices d’auto-corrélation et de la spectrométrie de masse à ultra-haute résolution a été développée pour accélérer l’identification des signaux discriminants issus des analyses métabolomiques par spectrométrie de masse.
Anal Chem, (2008), 80, 4918-32.
CEA/B. Maillère
Samedi 19 Juillet 2008
Dissociation entre la hiérarchie des épitopes et leur immunoprévalence lors des réponses CD8 au virus de la vaccine.

Cet article montre que des antigènes de la vaccine peuvent être une cible privilégiée de la réponse immunitaire pour des individus et être ignorés pour d’autres, alors que d’autres antigènes sont constamment reconnus mais avec une plus faible intensité.
J Immunol, (2008), 180, 7193-202.
Vendredi 20 Juin 2008
Un test pour la mesure de l’activité iodoperoxydase.

Un test spectrophotométrique pour la mesure des activités iodoperoxidases a été mis au point en plaque 96 puits et permet, pour la première fois, une mesure quantitative de l’activité enzymatique.
Anal Biochem (2008), 379, 60-65.
Mardi 13 Mai 2008
Etude in vivo des fonctions d’assemblages des nucléosomes des chaperons d’histones Asf1 dans des cellules humaines.

Deux équipes du SBIGEM et du SB2SM apportent la première determination directe in vivo du rôle des chaperons d’histone Asf1A et Asf1B dans l’assemblage des nucléosomes humains.
Mol Cell Biol (2008), 28, 3672-85.
Mardi 13 Mai 2008
Co-évolution à l’interface des complexes protéiques et prédiction de leurs structures tridimensionnelles.

Une nouvelle méthodologie baptisée SCOTCH permet de guider la prédiction de structure des complexes protéiques en exploitant l’information de co-évolution contenue dans les alignements multiples de séquences.
PNAS (2008), 105, 7708-13.
Lundi 12 Mai 2008
Etude du rôle des cofacteurs Ca2+ et Cl- dans le mécanisme d’oxydation de l’eau par le Photosytème II.

L’échange biosynthétique des ions Ca2+ et Cl- par les ions Sr2+ et Br- a permis d’identifier les étapes du cycle catalytique de l’oxydation de l’eau par le Photosystème II dans lesquelles ces ions sont impliqués.
J Biol Chem (2008), 283, 13330-40.
Lundi 12 Mai 2008
Détection de l'entérotoxine B de Staphylococcus Aureus en utilisant des lipososmes fluorescents comme marqueur dans un test immunochromatographique.

Une équipe du SPI a développé un procédé qui permet d'augmenter la sensibilité des tests rapides effectués sur bandelette (type "test de grossesse").
Anal Biochem (2008), 377, 182-188.
Vendredi 11 Avril 2008
Identification des premiers inhibiteurs du transport de l’iode dans la thyroïde.

Le criblage à haut débit d’une chimiothèque de 17000 composés sur la plateforme du SCBM a permis d’identifier les premiers inhibiteurs de la fonction du symporteur sodium/iode.
ChembioChem (2008), 9, 889–895
Jeudi 10 Avril 2008
Développement d’inhibiteurs puissants et sélectifs de l’Enzyme de Conversion de l’Angiotensine II (ACE2).

Vers l’étude du rôle de l’ACE2 in vivo dans la régulation de la pression artérielle grâce à la mise au point d’inhibiteurs puissants et sélectifs de l’ACE2.
J Med Chem (2008), 51, 2216-2226
Dimanche 09 Mars 2008
Quantification par immunopurification et spectrométrie de masse de la forme active d’un anticorps chimérique en sérum humain.

De la spectrométrie de masse pour les anticorps thérapeutiques.
Anal Chem (2008), 80, 1737-1745
Vendredi 15 Février 2008
Prédiction d’un réseau d’interactions protéine-protéine chez la cyanobactérie Synechocystis.

Des interactions protéine-protéine mises en évidence expérimentalement ont été utilisées pour prédire de nouvelles interactions dans une autre espèce suivant un transfert de connaissance d’un organisme à un autre.
JOBIM (2007), 229-234.
Vendredi 15 Février 2008
Les deux intermédiaires [Fe(IV)=O Trp*] dans la Catalase-Peroxidase de M. tuberculosis distingués par Spectroscopie RPE multifréquences (9-285 GHz): Réactivité vis-à-vis de l’isoniazide.

Cet article décrit les études détaillées menées pour élucider la structure électronique des espèces radicalaires formées comme intermédiaires rédox du cycle enzymatique de la peroxydase bi-fonctionnelle de M. tuberculosis en utilisant la spectroscopie RPE multifréquences combinée à de la mutagenèse dirigée et des marquages isotopiques sélectifs des tyrosines et tryptophanes.
J Am Chem Soc (2007), 129, 15954-15963.
Jeudi 14 Février 2008
Un système de gène rapporteur pour une détection individuelle du peroxyde d’hydrogène et de l’oxygène singlet.

Une équipe du SB2SM a mis au point un système pour détecter très spécifiquement des espèces réactives d’oxygène in vivo chez Chlamydomonas reinhardtii.
Plant J (2007), 50, 475-487.
Mardi 15 Janvier 2008
HSP90, SGT1, and RAR1 forment un complexe ternaire de chaperons essentiels à l’activation des complexes d’immunité chez les plantes.

Le trio de chaperons HSP90, SGT1 et RAR1 interagissent par différents sites pour réguler l’assemblage et l’activation des complexes de résistance aux agents pathogènes chez les plantes.
Plant Cell (2007), 19, 3791-3804.
Mardi 15 Janvier 2008
Structure d’un complexe ternaire entre le PSA humain, une forme acylée de son substrat et un anticorps activateur.

Une équipe du SIMOPRO présente la première structure tri-dimensionnelle de l’antigène-spécifique de la prostate humain complexé à la fois à un peptide substrat dérivé de la séménogéline I, et au fragment Fab’ d’un anticorps murin qui augmente l’activité enzymatique du PSA.
J Mol Biol (2008), 376, 1021-33.
Lundi 14 Janvier 2008
Inhibiteurs de MMPs et transplantation du foie

Préserver les fonctions hépatiques durant la transplantation du foie.
Hepatology (2008), 47, 177-185.
Lundi 14 Janvier 2008
Changements structuraux dans le complexe Mn4Ca du Photosystème II au cours du cycle enzymatique conduisant à l’oxydation de l’eau.

Une équipe du SB2SM a mis en évidence par spectroscopie EXAFS des modifications de l’environnement de l’ion Ca2+, cofacteur indispensable au mécanisme d’oxydation de l’eau, dans les différents états d’oxydo-réduction du cycle catalytique du Photosystème II.
PNAS (2008), 105, 1879-1884.
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