Vendredi 14 Novembre 2008
Déterminants moléculaires de la modification covalente de la métalloélastase matricielle par une sonde de photoaffinité : implications pour le développement « d’activity-based probes » et la variabilité conformationnelle des métalloprotéases matricielles.
J Biol Chem, (2008), 283, 31058-67.
CEA
Site de modification covalente d’une métalloprotéase à zinc par une sonde de photoaffinité.
Cette étude porte sur la détermination du site de modification covalente de la métalloélastase matricielle (MMP-12) par une sonde de photoaffinité interagissant spécifiquement avec le site actif de cet enzyme et incorporant un groupe azido comme groupement photoactivable. Grâce à la combinaison d’approches de séquençage d’Edman, d’études sur l’influence du pH, de mutants de la MMP-12 et d’analyses par nano ou micro-HPLC couplée à la spectrométrie de masse, les travaux d’une équipe du SIMOPRO ont montré que cette sonde de photoaffinité modifiait de façon covalente uniquement le groupe epsilon amino d’un résidu lysine dans la MMP-12. Les rendements de photomarquage élevés observés pour cette sonde vis-à-vis de la MMP-12 s’expliquent a) par un contexte structural et dynamique permettant le rapprochement dans l’espace entre la chaîne latérale du résidu lysine et le groupe nitréne formé par photo-activation de la sonde d’affinité et b) par le caractère nucléophile du résidu lysine en position 241.
Dabert-Gay AS, Czarny B, Devel L, Beau F, Lajeunesse E, Bregant S, Thai R, Yiotakis A, Dive V. (2008). Molecular determinants of matrix metalloproteinase-12 covalent modification by a photoaffinity probe: Insights into activity-based probe development and conformational variability of matrix metalloproteinases J Biol Chem. 283, 31058-67.