Distribution de la machinerie de transcription par l’ARN polymérase III et du facteur de transcription TFIIS dans les cellules souches embryonnaires de souris.
CEA
Chez les eucaryotes, trois ARN polymérases (Pol) se partagent la transcription du génome. La Pol III transcrit les ARN de transfert (ARNt), l’ARN ribosomal 5S et un petit nombre d’ARN non codant. Des chercheurs de l'iBiTec-S, de l’iRCM et de l'IG ont investigué dans les cellules souches embryonnaires (ES) de souris la distribution génomique de la Pol III et de ses facteurs. Ils ont mis en œuvre une méthode de localisation des protéines associées à l’ADN par immuno-précipitation de la chromatine couplée au séquençage à très haut débit de l’ADN enrichi. Parmi les gènes transcrits par la Pol III dans les cellules ES, on trouve la moitié des ARNt prédits mais aussi trente gènes de fonction inconnue. Les SINEs sont des séquences répétées à plus de 500 000 exemplaires dans le génome de la souris. Ce travail a établi que seuls 250 d’entre eux sont transcrits in vivo par la Pol III, suggérant l’existence de mécanismes réprimant la transcription de la majorité des SINES. Enfin, il a été montré que TFIIS, qui avait été initialement identifié comme un facteur d’élongation de la Pol II, occupe également les gènes de classe III in vivo. TFIIS joue donc probablement un rôle dans leur expression, indiquant que certains des composants des machineries de transcription sont partagés par les trois systèmes transcriptionnels.
Carrière L, Graziani S, Alibert O, Ghavi-Helm Y, Boussouar F, Humbertclaude H, Jounier S, Aude J C, Keime C, Murvai J, Foglio M, Gut M, Gut I, Lathrop M, Soutourina J, Gérard M, Werner M (2011). Genomic binding of Pol III transcription machinery and relationship with TFIIS transcription factor distribution in mouse embryonic stem cells. Nucleic Acids Res. (Sous presse).
Figure : Méthodologie utilisée pour déterminer la distribution génomique de la machinerie de classe III.
