Lettre 05 de décembre 2006


 
 
Développement d'une technique innovante pour la détection et le criblage à haut débit d'interactions biomoléculaires : application à la caractérisation d'anticorps anti-virus de l'Hépatite C.

L'analyse des interactions entre biomolécules est un enjeu important, que ce soit en recherche fondamentale pour analyser les mécanismes biologiques ou en recherche appliquée dans des domaines tels que la médecine ou la pharmacologie. Ces études seraient facilitées par l'utilisation d'un système miniaturisé permettant un criblage à haut débit des interactions entre diverses molécules.
C'est dans ce but que des chercheurs du laboratoire d'Immunochimie, en collaboration avec le CREAB, ont mis au point un système de type puces à protéines/peptides couplées à une méthode optique de détection des interactions, l'imagerie de la Résonance Plasmonique de Surface (SPRi). [en savoir plus]
Les caractéristiques de cette méthode, i.e. analyse multiparamétrique et en temps réel, rapidité, compatibilité avec des milieux biologiques complexes tels que du sérum, en font un outil prometteur pour de nombreuses applications en recherche fondamentale et clinique.

Clinical Chemistry, 2006, 52(2) : 255-262
Viral Immunology, 2006, 19(2) :324-334
Journal of Biomedical Nanotechnology, 2006, 2 : 29-35

Contact : Marie-Bernadette Villiers

   
 
Un test de criblage haut débit deux en un.

La tubuline est une cible thérapeutique validée. Si les poisons des microtubules ont fait leur preuve en chimiothérapie anti-cancéreuse, des phénomènes de chimiorésistance et de neurotoxicité sont fréquemment observés.
L'équipe du Centre de Criblage pour Molécules BioActives (CMBA) a mis au point et adapté à une utilisation robotisée un test cellulaire multiparamétrique permettant la sélection, au cours d'une même campagne de criblage, d'agents capables de dépolymériser le cytosquelette microtubulaire (type combretastatine) et d'agents capables de stabiliser le réseau microtubulaire (type paclitaxel). Ce test original et bien validé devrait permettre la sélection de nouveaux composés ciblant directement ou indirectement le cytosquelette microtubulaire, capables d'agir d'emblée dans un contexte cellulaire.
 
Le récepteur ALK1 n'est plus orphelin.

Un groupe encadré par le Dr Sabine Bailly du laboratoire d'Angiogenèse vient de publier que les BMP9 et BMP10 sont des ligands du récepteur ALK1 (David et al., 2006).
L'identification de BMP9 et BMP10 comme ligands d'ALK1 ouvre un tout nouveau champ d'investigation concernant leurs impplications dans l'angiogenèse. [en savoir plus] Ils pourraient être des outils importants dans les approches thérapeutiques dans la maladie de Rendu-Osler mais également des marqueurs dans les pathologies où l'angiogenèse est impliquée telles que la dégénerescence maculaire liée à l'âge, la toxémie gravidique et de nombreux cancers.

Blood, 2007, 109(5): 1953-1961

Contact : Sabine Bailly


* Un récepteur orphelin a une structure similaire à un récepteur identifié mais son ligand n'est pas encore connu.
   
 
Détoxication du superoxyde sans production d'H2O2. La superoxyde réductase, une métalloenzyme à cofacteur ferrocyanure.

Jusqu'à présent, seulement deux systèmes enzymatiques différents ont été décrits pour détoxiquer le radical superoxyde dans les cellules. Il s'agit de la superoxyde dismutase (SOD) et de la superoxyde réductase (SOR). Bien que ces enzymes soient très efficaces dans l'élimination du radical superoxyde, ils conduisent tous deux à la production de peroxyde d'hydrogène, un composé lui aussi toxique pour les cellules. Les activités SOD et SOR doivent donc être associées à des activités catalase et peroxydase pour permettre une détoxification complète.
Les chercheurs du laboratoire de Chimie et Biochimie des centres redox biologiques, en collaboration avec une équipe d'Orsay et une équipe du CEA de Cadarache, viennent de mettre en évidence une nouvelle activité de détoxication du radical superoxyde, permettant son élimination sans production de peroxyde d'hydrogène. [en savoir plus]
Ces résultats apportent un éclairage totalement nouveau sur les mécanismes cellulaires de détoxification du radical superoxyde.

PNAS, 2006, 103: 14750-147556

Contact : Vincent Nivière

   
 
Caractérisation d'une dioxygénase qui joue un rôle clé dans la dégradation des HAP.

Les bactéries jouent un rôle majeur dans l'élimination des polluants organiques persistants, grâce à des enzymes de dégradation spécifiques. C'est le cas de l'espèce Sphingomonas CHY-1 qui dégrade les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP).
De cette bactérie, une équipe du laboratoire de Biochimie et Biophysique des Systèmes Intégrés a purifié et caractérisé une dioxygénase qui catalyse l'étape initiale d'oxydation des HAP. Il s'agit d'une métalloenzyme à trois composantes, dont l'unité catalytique contient un cluster [2Fe-2S] et un atome de fer ferreux par sous-unité. [en savoir plus]
Ces études ont des perspectives d'applications biotechnologiques dans le domaine de la bioremédiation* des sites pollués.

Biochemistry, 2006, 45(40): 12380-12391
Biochemical and Biophysical Research Communications, 2007, 52(4): 861-866

Contact : Yves Jouanneau


* Bioremédiation : La bioremédiation est un ensemble de techniques consistant à augmenter la biodégradation ou la biotransformation, en inoculant des microorganismes spécifiques (bioaugmentation) ou en stimulant l'activité de populations microbiennes indigènes (biostimulation) par apport de nutriments et par ajustement des conditions de milieu.
 
La tyrosination de la tubuline est nécessaire pour l'interaction des microtubules et des protéines CAP-Gly*.

Les cellules des mammifères contiennent des réseaux filamentaires, dont le réseau microtubulaire, constitué de tubes d'un diamètre de 30 nm et de longueur variable, de l'ordre de un à plusieurs dizaines de micromètres. Ces tubes s'assemblent à partir d'une protéine, la tubuline. Les microtubules ont des propriétés physico-chimiques remarquables, qui leurs confèrent notamment une capacité d'auto-organisation et de motilité.
Dans un article récent, le laboratoire du Cytosquelette a identifié les cibles moléculaires du cycle de tyrosination. Il a montré que la tyrosination de la tubuline était requise pour la présence, aux extrémités microtubulaires, d'éléments clefs des complexes protéiques cités plus haut, et impliqués notamment dans la détermination de l'axe de division de la cellule et de ses interactions avec la matrice extra cellullaire. [en savoir plus]
Ces données fournissent des explications plausibles au rôle de la réaction de tyrosination de la tubuline dans la progression tumorale et le développement neuronal. Elles suggèrent également des stratégies pharmacologiques, pour rechercher des agents capables de compenser la suppression de la réaction de tyrosination dans les tumeurs malignes, avec comme perspective de ralentir l'évolution des tumeurs les plus agressives.

Journal of Cell Biology, 174(6): 839-849

Contact : Didier Job


* CAP-Gly : Protéine associée au cytosquelette et riche en glycine
   
 
Le programme ToxNucE.

Un des axes de recherche de la DSV concerne la Toxicologie Nucléaire Environnementale. L'objectif de ce programme est de préciser les effets toxiques d’éléments utilisés dans la recherche et l’industrie nucléaires, qu’il s’agisse de toxiques chimiques ou de radiotoxiques. Ceci afin, d’une part, d’identifier des seuils de toxicité pour l’homme et son environnement et, d’autre part, de proposer des solutions préventives, des dispositifs de surveillance efficaces ainsi que des remèdes pour dépolluer les sols et traiter d’éventuelles contaminations des personnes.
Le dernier numéro de la revue Biochimie regroupe plusieurs travaux réalisés dans les laboratoires PCV, CB, PMB, CP et BMC du département. Ces résultats sont le fruit de collaborations réalisées avec des équipes du CEA/LITEN, ESRF, CNAB, DSV/DEVM, INRA, CNRS/UCB/INSA et DSV/DRM.

Biochimie, 2006, 88: 1533-1547
Biochimie, 2006, 88: 1583-1590
Biochimie, 2006, 88: 1687-1692
Biochimie, 2006, 88: 1693-1705
Biochimie, 2006, 88: 1733-1742
Biochimie, 2006, 88: 1751-1765
Biochimie, 2006, 88: 1807-1814


   
 
Publications 2006 du DRDC

   
 
Nadia Saïdani doctorante de l'équipe de Chemogénomique comparative des plantes et des parasites apicomplexes du laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale a été sélectionnée pour faire parti des 100 jeunes français accompagnant Jacques Chirac en Chine du 25 au 28 octobre. Elle a pu à cette occasion rencontrer des biologistes chinois.

       
  Laboratoire d'Angiogenèse (Angio)
Laboratoire Biologie, Informatique et Mathématiques (BIM)
Laboratoire des Biopuces (Biopuces)
Laboratoire de Biochimie et Biophysique des Systèmes Intégrés (BBSI)
Laboratoire de Biophysique Moléculaire et Cellulaire (BMC)
Laboratoire de Chimie Biologie (CB)
Laboratoire Canaux Calciques, Fonctions et Pathologies (CCFP)
  Laboratoire de Chimie des Protéines (CP)
Laboratoire du Cytosquelette (CS)
Laboratoire de Développement et Vieillissement de l'Endothélium (DVE)
Laboratoire d'Immunochimie (ICH)
Laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale (PCV)
Laboratoire de Physico-chimie des Métaux en Biologie (PMB)
Laboratoire de Transduction du Signal (TS)

       
  Les séminaires au DRDC

Les faits marquants
 


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Marie-Bernadette Villiers.