À la suite d'un travail méthodologique dans un premier temps, des chercheurs du laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale, en collaboration avec le laboratoire de Chimie des Protéines différentes méthodes d'extraction et de précipitation de protéines solubles provenant de cellules d'Arabidopsis thaliana en culture liquide compatibles avec une séparation par électrophorèse bidimensionnelle.
Un protocole a donné une bonne résolution et reproductibilité et un nombre élevé de spots (~ 1800 spots/gel). À partir de suspensions cellulaires d'Arabidopsis thaliana cultivées dans deux milieux de cultures (Gambord et, Murashige & Skoog), trois ou quatre gels 2-D indépendants ont été quantifiés afin d'évaluer la variabilité et de sélectionner un jeu de spots hautement reproductible. L'identification des protéines majeures par spectrométrie de masse (MALDI-TOF-MS ou ES-MS-MS) a permis de réaliser la cartographie du protéome soluble d'Arabidopsis thaliana dans les deux milieux de cultures et de mettre en évidence l'influence du milieu de culture sur l'expression de protéines notamment impliquées dans le métabolisme de l'azote et du soufre. Ce travail constitue une étape importante pour de futures études protéomiques concernant la réponse d'Arabidopsis thaliana à des stress biotiques et abiotiques.
Mercredi 01 Mars 2006
RÉFÉRENCE
Sarry JE, Kuhn L, Le Lay P, Garin J and Bourguignon J
ADynamics of Arabidopsis thaliana soluble proteome in response to different nutrient culture conditions.
Electrophoresis, 2006, 27: 495-507
Dynamique du protéome d'Arabidopsis thaliana : établissement de cartographies 2D du protéome soluble de cellules d'Arabidopsis thaliana et influence du milieu de culture sur ce protéome
Les résultats du Laboratoire de Physiologie Cellulaire Végétale en collaboration avec le Laboratoire de Chimie des Protéines ont permis de réaliser la cartographie du protéome d'Arabidopsis thaliana en réponse aux nutriments des milieux de culture et de mettre en évidence l'influence du milieu de culture sur l'expression de protéines.
Contact : Jacques Bourguignon
RÉFÉRENCE
Sarry JE, Kuhn L, Le Lay P, Garin J and Bourguignon J
ADynamics of Arabidopsis thaliana soluble proteome in response to different nutrient culture conditions.
Electrophoresis, 2006, 27: 495-507