Lundi 02 Avril 2007
Une dissection protéomique de la vacuole d’Arabidopsis thaliana
Afin de mieux comprendre les phénomènes liés à l’adaptation aux métaux lourds et radionucléides, une équipe du laboratoire de Physiologie Cellulaires Végétale, en collaboration avec le laboratoire d'Étude de la Dynamique des Protéomes, a lancé une étude portant sur le protéome de la vacuole de la plante modèle, Arabidopsis.
La vacuole est un compartiment cellulaire qui joue un rôle important dans la régulation de l’homéostasie de la plante et dans l’adaptation de celles-ci aux stress biotiques et abiotiques. Afin de mieux comprendre les phénomènes liés à l’adaptation aux métaux lourds et radionucléides, des chercheurs du laboratoire de Physiologie Cellulaires Végétale, en collaboration avec le laboratoire d'Étude de la Dynamique des Protéomes, ont lancé une étude portant sur le protéome de la vacuole de la plante modèle, Arabidopsis.
Cette étude a conduit à l’indentification de 650 protéines dont 450 sont des protéines membranaires ou associées et dont seulement 20% ont des activités vacuolaires décrites dans la littérature. Outre l’ATPase à protons de type vacuolaire, pas moins d’une centaine de transporteurs pour la plupart de fonction inconnue ont été identifiés. La superfamille des transporteurs ABC (ATP-Binding Cassette) est particulièrement représentée car 15 des 140 membres déduits du génome d’Arabidopsis ont été identifiés avec une surreprésentation de la sous-famille des protéines de type MRP qui pourraient être impliquées dans de nombreux processus de détoxications. Outre ces transporteurs, une forte proportion de protéines probablement impliquées dans des rôles de régulation ont été caractérisées montrant que cette usine de retraitement et de stockage serait étroitement contrôlé. La fonction de la grande majorité des protéines demeure inconnue et constitue un formidable terrain d’investigation pour la compréhension de la genèse et des processus de régulation liés à cette membrane et à ce compartiment.
Cette étude a conduit à l’indentification de 650 protéines dont 450 sont des protéines membranaires ou associées et dont seulement 20% ont des activités vacuolaires décrites dans la littérature. Outre l’ATPase à protons de type vacuolaire, pas moins d’une centaine de transporteurs pour la plupart de fonction inconnue ont été identifiés. La superfamille des transporteurs ABC (ATP-Binding Cassette) est particulièrement représentée car 15 des 140 membres déduits du génome d’Arabidopsis ont été identifiés avec une surreprésentation de la sous-famille des protéines de type MRP qui pourraient être impliquées dans de nombreux processus de détoxications. Outre ces transporteurs, une forte proportion de protéines probablement impliquées dans des rôles de régulation ont été caractérisées montrant que cette usine de retraitement et de stockage serait étroitement contrôlé. La fonction de la grande majorité des protéines demeure inconnue et constitue un formidable terrain d’investigation pour la compréhension de la genèse et des processus de régulation liés à cette membrane et à ce compartiment.
Contacts : Jacques Bourguignon
Michel Jaquinod
RÉFÉRENCE
Jaquinod M, Villiers F, Kieffer-Jaquinod S, Hugouvieux V, Bruley C, Garin J and Bourguignon J
A proteomic dissection of Arabidopsis thaliana vacuoles isolated from cell culture.
Molecular and Cellular Proteomics, 2007, 6(3): 394-412
Jaquinod M, Villiers F, Kieffer-Jaquinod S, Hugouvieux V, Bruley C, Garin J and Bourguignon J
A proteomic dissection of Arabidopsis thaliana vacuoles isolated from cell culture.
Molecular and Cellular Proteomics, 2007, 6(3): 394-412