Directeur
Le Laboratoire d'Etude de la Dynamique des Protéomes (EDyP) a pour vocation de contribuer à la compréhension de processus biologiques par le développement de méthodologies dans le domaine de la micro-analyse des protéines. La composante technologique du Laboratoire est fermement ancrée dans des applications biologiques. La mission du Laboratoire implique l'acquisition d'un savoir-faire qui est utilisé (i) dans le cadre de nos propres thèmes de recherche en biologie cellulaire et (ii) dans le cadre de collaborations de plus en plus nombreuses, fruits de notre maîtrise des outils protéomiques. Les programmes de recherche et les développements technologiques et méthodologiques que nous avons menés ces dernières années nous ont permis de progresser de manière significative dans la connaissance des répertoires de protéines associées à différents compartiments intracellulaires, en particulier les compartiments de la voie endocytaire des cellules de mammifères, ainsi que plusieurs systèmes membranaires modèles de la plantule Arabidopsis thaliana. Ces études ont participé à une meilleure connaissance des fonctions biologiques de ces compartiments. Elles ont par exemple permis de préciser les liens qui existent entre exosomes et voie endocytaire, de découvrir que la membrane du phagosome est en partie constituée de membrane provenant du reticulum endoplasmique, de découvrir de nouveaux transporteurs en étudiant le protéome membranaire de la vacuole, la mitochondrie et la membrane plasmique d'Arabidopsis thaliana. Dans le domaine des méthodes d'analyse protéomique, nous avons progressivement consolidé une expertise qui nous permet d'établir avec une grande fiabilité les répertoires protéiques associés aux échantillons biologiques que nous étudions. Même si ces compétences doivent sans cesse être améliorées, notamment dans le but d'être capable de prendre en charge l'analyse d'échantillons biologiques de plus en plus complexes, une part importante de nos efforts porte désormais sur la mise en place de méthodes permettant la réalisation d'analyses protéomiques quantitatives et la caractérisation des modifications post-traductionnelles des protéines.