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Instituts/ Institut de Recherches en Technologies et Sciences pour le Vivant (iRTSV)/ Unités / Biologie à Grande Échelle (BGE)/ Groupe Informatique Pour les Scientifiques du sud-Est (GIPSE)/ Bienvenue

Bienvenue

Responsable
 
Céline Charavay
CEA Grenoble
iRTSV/GIPSE
17 rue des Martyrs
38 054 Grenoble cedex 09
Tel. : (33) 4 38 78 93 65
Fax : (33) 4 38 78 43 37
 
Membres du groupe
 
Vincent Dorffer
Stéphane Segard
 
Présentation
 
Le Groupe Informatique Pour les Scientifiques du sud-Est intervient transversalement pour les instituts iBEB, iBS et iRTSV dans des missions de support aux projets de recherche des laboratoires.

Son action se situe donc dans le cadre général de « l'informatique pour la biologie ».

Les missions du GIPSE se situent dans deux domaines :
  • Développement de logiciels et systèmes d'information scientifiques nécessaires à la recherche en biologie,
  • Conception et gestion d'infrastructures informatiques spécifiques aux laboratoires de recherche.

La pertinence des projets de développement logiciel pris en charge par le GIPSE est établie par un comité de pilotage composé des directeurs des trois instituts DSV du sud-est.
 
Missions de développement logiciel
 
• Évaluation et spécifications des besoins logiciels exprimés par les laboratoires, en collaboration avec les chercheurs,

• Développement ou adaptation de logiciels spécifiques aux problématiques de la biologie.


Depuis le début de son activité en 2005, le GIPSE a travaillé sur les projets suivants :
  • Projet FlexibleMeccano :
    Logiciel d'analyse de données de Résonance Magnétique Nucléaire (RMN) mesurées sur des protéines désordonnées.
  • Projet Morpheus :
    Logiciel de recherche des sites de fixation d'un facteur de transcription.
  • Projet OptiLink :
    Logiciel de génération de scripts pour le pilotage d'un robot d'une plateforme de cristallisation de protéines.
  • Projet RoBioMOL :
    Logiciel de gestion de campagnes de clonage de gènes et d'expression de protéines.
  • Projet SimuMoss :
    Logiciel d'analyse de spectres Mössbauer.
  • Projet SculptorCNS :
    Patch permettant d'intégrer 5 contraintes orientationelles au logiciel de dynamique moléculaire CNS développé par l'université de Yale.
  • Projet TAMIS :
    Logiciel dédié à la recherche de molécules bioactives sur des cibles cellulaires.
 
Missions d'infrastructures
 
• Évaluation des besoins en infrastructures scientifiques exprimés par les laboratoires,
• Maîtrise d'ouvrage d'infrastructures scientifiques,
• Conseil auprès des chercheurs pour le choix des matériels de laboratoire.