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Projet TAMIS



Laboratoire impliqué
 
Centre de Criblage pour Molécules Bioactives de l'Institut de Recherches en Technologies et Sciences pour le Vivant (iRTSV/CMBA)
 
Contexte scientifique
 
Le criblage automatisé de collections de molécules (chimiothèques) permet de découvrir des molécules actives sur des systèmes biologiques (molécules bio-actives). Celles-ci munissent la recherche de nouveaux « outils » moléculaires et permettent l'étude de fonctions biologiques.

L'activité de criblage de plusieurs milliers de composés a besoin de moyens informatiques adaptés, tant pour la sauvegarde et l'analyse des résultats et des paramètres des criblages que pour l'exploitation globale des informations relatives aux interactions molécules-cibles. C'est la raison pour laquelle le logiciel TAMIS a été développé.
 
Description du projet
 
Le projet consiste à développer le logiciel TAMIS qui comporte les fonctionnalités suivantes :

• gestion des informations relatives aux molécules : généalogie des plaques pour le suivi qualité, interrogation des informations chimiques ou non chimiques relatives aux molécules disponibles sur la plateforme
• gestion d'informations relatives aux expérimentations
• stockage des résultats de criblages
• analyse des résultats de criblages (
Figure suivante)
 
Si vous souhaitez visualiser une démonstration de TAMIS ou télécharger ce logiciel (licence CeCILL-C), cliquez ici.
 


Interface permettant d'analyser les signaux d'un criblage.
Chaque point correspond à un signal. En cliquant sur un point, l'utilisateur peut visualiser la molécule sur laquelle le signal a été acquis. Sur la base de ces signaux traduisant l'activité des molécules testées, une valeur de signal (dit seuil de bio-activité représenté ici par une ligne rouge) est déterminée, scindant en deux sous-ensembles les résultats du criblage : l'ensemble des molécules supposées bio-actives (points en rouge) et l'ensemble des molécules supposées bio-inactives (points en bleu). Les molécules contrôles sont représentées en vert (contrôles négatifs) et en jaune (contrôles positifs).