Le chloroplaste est le centre de production d'un nombre important de biomolécules (acides gras, acides aminés, sucres, vitamines, terpènes, alcaloïdes, phénols etc) qui présentent un grand intérêt pour les bioénergies comme pour l'alimentation et la santé humaine. Véritable usine énergétique de la cellule végétale, cet organite photosynthétique est responsable de la synthèse de la totalité de la biomasse de la plante, et constitue la principale « pompe à CO2 », agissant ainsi sur l'environnement et le climat.Équipe 01 D-Phy-Chloro
Régulation de la dynamique du protéome, de la biogenèse et de la physiologie du chloroplaste
 Responsable |
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| Membres de l'équipe |
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 Gilles Curien : CR1 CNRS Giovanni Finazzi : DR2 CNRS Marcel Kuntz : DR2 CNRS Michel Matringe : DR2 INRA Norbert Rolland : DR1 CNRS Daphné Seigneurin-Berny : CR1 CNRS Daniel Salvi : IE CNRS Cécile Giustini : AI INRA Lucas Moyet : CDD AI UJF (Labex GRAL) Guillaume Allorent : Post-doc (ANR) James Connorton : Post-doc (ANR) Dimitris Petroutsos : Post-doc (ANR) Elisa Dell'Aglio : Doctorante UJF (programme international IRTELIS CEA) Emeline Sautron : Doctorante UJF (Labex GRAL/CEA) Martino Tomizioli : Doctorant UJF (ANR) Faustine Delpierre : BTS alternance Stefan Kreida : Master Université Uppsala Anciens membres de l'équipe : Matthieu Graindorge, PhD + ATER UJF 2007-2012, maintenant Prépa Agrégation Biologie Jacques Joyard, DRCE CNRS -2010, maintenant conseiller scientifique, iRTSV Céline Cataye, BTS 2009-2010, maintenant CDD AI, LPCV Sylvain Boutigny, PhD 2006-2009, maintenant Post-doc, USA Sophie Le Gall, PhD 2006-2009, maintenant Ingénieur de Recherche INRA, Nantes Mylène Charbonnot, BTS 2007-2009, maintenant CDD CHU, Grenoble Annie Frelet, Post-doc 2006-2009, maintenant Chercheur CNRS, Saclay Ariane Atteia, Post-doc 2005-2006, maintenant Chercheur CNRS, Marseille |
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| Introduction |
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Le chloroplaste est le centre de production d'un nombre important de biomolécules (acides gras, acides aminés, sucres, vitamines, terpènes, alcaloïdes, phénols etc) qui présentent un grand intérêt pour les bioénergies comme pour l'alimentation et la santé humaine. Véritable usine énergétique de la cellule végétale, cet organite photosynthétique est responsable de la synthèse de la totalité de la biomasse de la plante, et constitue la principale « pompe à CO2 », agissant ainsi sur l'environnement et le climat. |
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| Activités de recherche |
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Un des aspects le plus fascinant (et le moins étudié) des organismes photosynthétiques est leur capacité à gérer des variations rapides des conditions environnementales et à réorienter leur métabolisme en réponse à ce que l'on dénomme habituellement « stress » (lumière, nutriments, froid, etc…) De la rapidité de ces réponses et de leur efficacité dépend le sort de la plante dans les différentes conditions qu'elle rencontrera au cours de son cycle de vie. Ce type de réponses implique à court terme des changements métaboliques, à plus long terme des changements d'expression génique et donc de composition protéique. Notre approche de l'étude intégrée de la dynamique et de la physiologie du chloroplaste va nous permettre de déchiffrer les réseaux de régulations impliqués et ainsi de mieux comprendre la capacité des plantes à répondre aux conditions variables de l'environnement.
 Les approches utilisées dans l'équipe sont la protéomique à grande échelle, la microscopie confocale, des mesures in vivo de la photosynthèse par des techniques de biophysique, des mesures de la synthèse de pigments et de vitamines, la caractérisation de transports d'ions ou de protéines. Une approche de modélisation analytique est aussi utilisée pour intégrer des données de biologie cellulaire et de biochimie. |
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| Activités de recherche : Quelques faits-marquants |
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| Publications de l'équipe |
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| Mots clés |
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Chloroplaste, Métabolisme, Photosynthèse, Enveloppe du chloroplaste, Transports, ATPases, Biogenèse du chloroplaste, Plante, Algue, Physiologie, Biochimie, Protéomique, Biophysique, Biologie des systèmes.
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| Projets collaboratifs en cours |
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• Grant ITN FP7. Projet "AccliPhot". Coordinateur de l'équipe Giovanni Finazzi. 2013-2015
• Grant PhD Labex GRAL & CEA. Projet "ATPases". Coordinateur du projet Daphné Berny. 2012-2015. • Grant ANR Bioenergy. Projet "DiadomOil". Coordinateur de l'équipe Giovanni Finazzi, 2012-2015. • Grant Engineer Labex GRAL. Projet "Chloroplast". Coordinateur du projet Norbert Rolland. 2012-2014. • Grant INRA. Projet "Mixoalgues". Coordinateur du projet Giovanni Finazzi. 2012-2014. • Grant CEA. Projet “Bioenergy”. Coordinateur de l'équipe Giovanni Finazzi. 2012-2013. • Grant ANR Genomics and Plant Biotechnologies. Projet "Chloro-Types". Coordinateur du projet Norbert Rolland. 2011-2014. • Grant ANR Blanc 2010. Projet "Chloro-Pro". Coordinateur Norbert Rolland. 2011-2014. • Grant ANR Blanc. Projet "PhytAdapt". Coordinateur du projet Giovanni Finazzi. 2011-2013. • Grant PhD CEA IRTELIS. Coordinateur du projet Gilles Curien. 2010-2013. |
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| Projets achevés |
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• Grant INRA. Project "Fib". Coordinateurs du projet Michel Matringe/Marcel Kuntz. 2011.
• Grant ANR Génoplante. Projet "Glyco-Chloroplast". Coordinateur de l'équipe Norbert Rolland. 2007-2010. • Grant CNRS Post-doc. Projet “Membrane proteins”. Coordinateur du projet Norbert Rolland. 2008-2009. • Grant CEA. Projet "CEA-PM: Screening of Alternative Expression systems for the Production of Membrane Proteins". Coordinateur du projet Norbert Rolland. 2007-2009. • Grant PhD CEA. Projet “Atpases”. Coordinateurs du projet Daphné Berny/Norbert Rolland. 2006-2009. • Grant CNRS Post-doc. Projet “Chlamydomonas proteomics”. Coordinateur du projet Norbert Rolland. 2005-2006. • Grant Région Rhône-Alpes/CEA. Projet "Development of an in vitro expression technology for the production of membrane proteins". Coordinateur du projet Norbert Rolland. 2003-2005. • Grant Génoplante 2 - New Tools (phase 2). Projet "Characterization of Arabidopsis thaliana gene products: Hydrophobic proteome of membranes". Coordinateur du projet Norbert Rolland. 2002 -2005. • Grant PhD CEA. Projet “Alternative chloroplast targeting pathways”. Coordinateur du projet Norbert Rolland. 2001-2004. • Grant Génoplante 2 - New tools. Projet "Chloroplast microarrays". Coordinateur du projet Norbert Rolland. 2001-2003. • Grant CEA National Program of Nuclear Toxicology. Projet "Impact of radionuclides on the metabolism of higher plants". Coordinateur du projet Norbert Rolland. 2001-2003. • Grant Génoplante I - Functional Analyses (AF 1999-035). Projet "Functional genomics of membrane transport systems in Arabidopsis thaliana". Coordinateur de l'équipe Norbert Rolland. 2000-2001. • Grant Génoplante I - New tools (NO 1999-3663). Projet "Characterization of Arabidopsis thaliana gene products: Structural and functional analysis of cell and subcellular proteomes". Coordinateur de l'équipe Norbert Rolland. 2000-2001. • Grant CEA «Action Incitative Chimie». Projet "Physiology and genetics of transport of radionuclides in plants". Coordinateur de l'équipe Norbert Rolland. 1999-2001. • Grant CNRS “Physique et Chimie du Vivant”. Projet 1998-122 "Subcellular plant proteome: Subcellular localization of gene products of Arabidopsis thaliana". Coordinateur du projet Norbert Rolland. 1998-2000. |
