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Wednesday April 29 2009

Radiotolérance des bactéries : Alliance entre protéomique et génomique

PLoS Genetics (2009), 5(3) : e1000434
CEA-DSV-iBEB-SBTN (Jean Armengaud & Alain Lorphelin)
Des équipes de l’iBEB (CEA/Cadarache et CEA/Marcoule) et de l’IG (CEA/Évry) ont conjugué leurs savoir-faire pour réaliser l’annotation protéo-génomique primaire la plus complète jamais décrite à ce jour. Bactérie capable de survivre dans l’environnement particulièrement hostile du Sahara, Deinococcus deserti répare, de façon surprenante, son génome très endommagé par la dessiccation ou les rayonnements ionisants.


En utilisant les techniques de protéomique, ces chercheurs ont validé 40% des 3 455 gènes prédits par l’analyse génomique de cette bactérie, corrigé plusieurs erreurs de prédiction et semi-quantifié les protéines correspondantes. La présence de multiples copies de protéines dédiées à l’import de manganèse et de nutriments ainsi qu’à la réparation de l’ADN suggère un rôle de ces protéines dans l’adaptation de Deinococcus deserti à son environnement hostile.  En parallèle, en collaboration avec l’IBS (CEA/Grenoble), les chercheurs ont étudié par génétique et biologie structurale la protéine IrrE et confirmé son rôle essentiel dans la radiotolérance de Deinococcus. L’ensemble de ces résultats permet de mieux comprendre les bases moléculaires de la radiotolérance et de l’adaptation aux environnements extrêmes des bactéries Deinococcaceae.

Pour en savoir plus :



Contacts : Arjan de Groot, Jean Armengaud, Laurence Serre