Thèmes de recherche du LEMiRE
- Thèmes de recherche du LEMiRE
- Interactions plantes-bactéries
- Cycle cellulaire de Ramlibacter tataouinensis
Nos Objectifs
Les changements rapides des conditions physico-chimiques de l’environnement des bactéries requièrent un ajustement de leur physiologie pouvant impliquer une modulation de l’expression de leurs gènes. Ces réponses adaptatives découlent essentiellement de la perception de signaux dans l’environnement externe de la bactérie par des senseurs et qui se traduit par l’activation de l’expression ou de la traduction des gènes requis pour surmonter le stress rencontré.
Nos travaux visent à étudier les mécanismes d’adaptation aux contraintes environnementales de trois modèles bactériens qui représentent des modalités différentes de tolérance aux stress liés à leurs habitats. Ces études sont réalisées dans le cadre de thèmes suivants:
1- La plasticité génomique de Pseudomonas brassicacearumconfère un avantage à cette espèce bactérienne dans la rhizosphère d’Arabidopsis thaliana, dans la compétition pour les ressources de son environnement et dans la tolérance aux toxiques potentiellement présents dans sa niche écologique.
2- Un cycle cellulaire sous le contrôle de la lumière, contribue à l’adaptation de Ramlibacter tatouinensis au désert et lui confère la tolérance à la dessiccation et plus largement aux conditions rencontrées dans un désert chaud et sec.
Ces thèmes de recherche s’appuient sur des approches génétique, biochimique, moléculaire, -omiques et bénéficient du développement d’outils bioinformatiques qui contribuent à une meilleure compréhension de l’écologie de ces bactéries par l’analyse de leurs génomes et de leurs réponses génomiques.