Bases de données
- Bases de données
- Logiciels
GENOMES MICROBIENS
- Bases signalisation/génome (PGDBs) créées dans le contexte de la plateforme MicroScope
Base de données relationnelles (Procaryotic Genome DataBase, PkGDB)
Système de Gestion de Base de Données MySQL distribué sous licence Open-Source.
PROTEOMIQUE
AT_Chloro (2007):
- banque de protéines identifiées lors d'analyses protéomiques des membranes cellulaires et subcellulaires d'Arabidospsis. Cette banque propose la description et l'annotation fonctionnelle issue des prédictions bioinformatiques (domaines transmembranaires, localisation subcellulaire...) mais donne aussi accès aux informations issues d'autres banques de données protéiques (TAIR, NCBI, ExPaSy).
Référence bibliographique: Ferro et al. (2010) AT_CHLORO: A comprehensive chloroplast proteome database with subplastidiallocalization and curated information on envelope proteins. [Epub ahead of print]; voir aussi le communiqué de presse CEA-DSV: AT_Chloro, une base de données unique dédiée aux protéines du chloroplaste accessible à la communauté scientifique.
Accéder aux bases de données AT_Chloro et Plant Proteomics 2007.
Contact: myriam.ferro@cea.fr