Présentation
Les études du Service de Biologie Intégrative et de Génétique Moléculaire portent sur la compréhension des mécanismes fondamentaux mis en place par la cellule pour répondre à son environnement naturel ou aux stress de diverses natures. A ce titre nos recherches portent sur les mécanismes de contrôle des dommages de l’ADN, ceux régulant l’expression des gènes, l’implication de la structure chromatinienne dans les mécanismes épigénétiques, et sur la nature des réponses aux stress induits par les oxydants ou les métaux lourds.
Les équipes du service étudient différents systèmes modèles choisis pour leur intérêt expérimental tels la cyanobactérie Synechocystis, la levure Saccharomyces cerevisiae, la souris ou divers modèles cellulaires mammifères. Un grand nombre de méthodes récentes qu’elles soient ciblées (génétique, biochimie, biologie moléculaire ou cellulaire...) ou globales (transcriptomique, protéomique, métabolomique, bio-informatique, modélisation...) utilisent ces différents modèles de manière intégrée au niveau moléculaire, cellulaire, ou tissulaire.
Le lien web de ce service: http://www-dsv.cea.fr/ibitecs/sbigem
Le Service est organisé en cinq laboratoires dont les thématiques sont les suivantes :
Laboratoire de Biologie Intégrative (LBI)
Ce laboratoire analyse les réponses de la levure S. cerevisiae et de la cyanobactérie Synechocystis aux stress résultants de l’exposition aux métaux, lourds ou « biologiques », ou aux agents oxydants, exogènes ou endogènes. Ces stress provoquent des reprogrammations métaboliques qui sont étudiées par des approches de biologie intégrative (génomique fonctionnelle, protéomique, métabolomique, bio-informatique et modélisation) de manière à comprendre les mécanismes moléculaires mis en jeux par les deux principaux types de cellules: hétérotrophes (comme les cellules humaines) et photosynthétiques (comme les cellules de plantes)
Laboratoire du Métabolisme de l'ADN et Réponses aux Génotoxiques (LMARGe)
Le laboratoire s’intéresse à différents aspects du métabolisme de l'ADN tels que la réparation, la réplication ou le métabolisme des acides nucléiques (en particulier la ribonucléotide réductase), ainsi que l’analyse des réponses aux génotoxiques coordonnées par les mécanismes de surveillance de l’ADN chez la levure S. cerevisiae et chez les cellules de mammifère.
Laboratoire de Physiogénomique (LPG)
Le projet principal consiste à caractériser les différentes régions du cerveau de souris par leur patron d’expression génique. De nouveaux
marqueurs moléculaires ont été identifiés. Leur rôle physiologique est étudié en analysant leur expression dans différents modèles physiopathologiques, et en recherchant par protéomique ceux codants des protéines sécrétées.
Le second projet porte sur la caractérisation moléculaire de vestiges animaux de la plus ancienne grotte ornée du monde, la Grotte Chauvet (Ardèche). Il tente aujourd’hui de décrypter le génome mitochondrial complet de l’ours des cavernes (Ursus spelaeus).
Laboratoire Régulation de l'Expression des Gènes et Epigénétique (LREGE)
Le laboratoire étudie les mécanismes moléculaires de l’expression des gènes et son contrôle chez les Eucaryotes. La fonction et l’organisation de différents complexes macromoléculaires impliqués dans la transcription des gènes et leur régulation en conditions de stress sont analysées. La structure chromatinienne jouant un rôle clef dans la régulation de l’expression génique, une équipe s’intéresse aux mécanismes épigénétiques impliqués lors du développement et de la différenciation, ou pendant le processus de cancérisation.
Laboratoire Stress Oxydants et Cancer (LSOC)
L’activité du laboratoire s’organise autour de deux thèmes. Le premier porte sur la biologie redox et les voies de signalisation de ce stress chez S. cerevisiae et chez les mammifères. Il étudie l’impact biologique des espèces réactives de l’oxygène au plan toxique, leur rôle dans la signalisation et les mécanismes mis en jeu pour y répondre.
Le second thème de recherche s’intéresse à la stabilité génomique chez les eucaryotes, notamment suite à un stress génotoxique. Il vise à la compréhension des mécanismes qui, d’une part, assurent la fidélité de la duplication et la ségrégation du génome assemblé en chromatine et qui, d’autre part, surveillent le bon déroulement de ces processus.