Direction des sciences du vivant

• étudie la structure et la réactivité des métalloenzymes (protéines fer-soufre, réductases, monooxygénases,...)
• étudie la structure et la fonction des systèmes de transport d’ions métalliques : protéines membranaires et métallorégulateurs impliqués dans le contrôle de l’homéostasie.
• étudie des systèmes de défense contre les espèces réactives de l’oxygène (superoxyde et peroxyde d’hydrogène).
• étudie l'homéostasie des métaux et le stress métallique avec l’étude des flux métalliques dans la cellule et les maladies associées. Avec, en particulier, l’étude du stress engendré par les métaux lourds et la défense cellulaire (toxicologie nucléaire).
• développe des recherches sur la biosynthèse des centres fer-soufre et des sites actifs des hydrogénases.
• développe des recherches en catalyse biomimétique avec, d’une part la recherche de nouveaux catalyseurs pour la production et l’oxydation de l’hydrogène et, d’autre part, l’étude de nouveaux catalyseurs pour l’oxydation.
• développe la modélisation des interactions métal-ligands en biologie par des approches de chimie théorique et dynamique moléculaire.
• étudie le magnétisme et la structure électronique des centre métalliques.

Le Laboratoire d’Etude de la Dynamique des Protéomes (EDyP) du CEA Grenoble est une unité mixte (U880) qui a pour tutelles le CEA, l’INSERM et l’Université Joseph Fourier. Le Laboratoire EDyP est reconnu par les organismes de recherche comme une plate-forme RIO opérationnelle ; cette plate-forme RIO est également la plate-forme protéomique de la Génopole Rhône-Alpes.

Le Laboratoire EDyP utilise l’état de l’art dans le domaine de la biochimie et la spectrométrie de masse dans le but de maîtriser et développer de nouvelles méthodes d’analyse protéomique. Pour atteindre cet objectif, l’activité du Laboratoire repose sur quatre groupes technologiques chargés respectivement de :
• L’analyse d’échantillons biologiques complexes par spectrométrie de masse à transformée de Fourier ;
• L’analyse des modifications post-traductionnelles des protéines ;
• Le développement d’outils dans le domaine de l’informatique et la bioinformatique appliquées à la Protéomique ;
• La gestion d’une plate-forme instrumentale robotisée permettant de réaliser des analyses protéomiques à haut débit et très haute sensibilité.

L’expertise du Laboratoire EDyP est utilisée dans le cadre de trois principales thématiques de recherche : l’étude de la dynamique des protéomes cellulaires et subcellulaires, la recherche et la validation de biomarqueurs de pathologies, et l’utilisation des données protéomiques pour l’annotation des génomes.

• étudie les mécanismes moléculaires par lesquels les tissus sains (en particulier les glandes endocrines) et tumoraux contrôlent leur vascularisation,
• étudie le rôle des constituants des jonctions intercellulaires endothéliales dans l’angiogenèse tumorale, l’athérosclérose et l’inflammation,
• caractérise l’implication de l’altération des fibres élastiques dans le vieillissement artériel,
• étudie les mécanismes moléculaires de la tumorigenèse corticosurrénalienne,
• développe des thérapies anti-tumorales expérimentales basées sur l'inhibition de l'angiogenèse
• met en place des outils pour l’imagerie microvasculaire.

• Étudie la fonction des microtubules et de leurs effecteurs dans la mitose, la morphogenèse cellulaire et le trafic cellulaire en vue d’obtenir des informations importantes sur la physiologie cellulaire durant la différentiation cellulaire, le neuro-développement, la plasticité synaptique.
• Évalue les conséquences de la perturbation des effecteurs microtubulaires aux niveaux moléculaires, cellulaires et dans l’animal entier pour mieux appréhender le rôle des microtubules et de leurs effecteurs dans certaines situations pathologiques (cancer et maladies mentales).

• développe un programme de recherche ciblé sur la transduction du signal calcium et de la différenciation des cellules progénitrices neurales dans un contexte physiologique et physiopathologique d’invasion tumorale.
• étudie les mécanismes de phosphorylation des protéines à travers l’étude des relations structure-fonction de la protéine-kinase CK2
• étudie les voies de signalisation associées à la réponse inflammatoire et immunitaire innée.

• étudie les mécanismes moléculaires par lesquels les bactéries et les cellules eucaryotes s'adaptent et intègrent divers signaux de stress, tant sur le plan de la dynamique cellulaire, du trafic membranaire et des modifications du protéome, que des programmes de différenciation, de développement, ou de mort cellulaire.

• développe des projets de recherche en bioinformatique
• assure l’animation scientifique et la formation des chercheurs aux outils et méthodologies de bioinformatique

Développe des microsystèmes, notamment des puces à cellules pour l’analyse multiparamétrique de cellules, en s’appuyant sur des compétences dans les domaines de la biologie, des nano- et micro-technologies, de la chimie de surface, de la détection optique et électronique, de la modélisation et de la bioinformatique.

• Développement et déploiement des applications logicielles nécessaires à la recherche en biologie,
• Conception des infrastructures informatiques spécifiques aux laboratoires de recherche.

• est chargé de l'exploitation des plateaux technologiques de l’institut de Recherches en Technologies et Sciences pour le Vivant
• est chargé de l'information scientifique et technique.

Le laboratoire PCV (UMR5168 CNRS CEA UJF INRA) étudie les interactions entre les divers compartiments de la cellule végétale, leur modulation fine au cours des processus de différenciation cellulaire et leur perturbation par les conditions du milieu. Le laboratoire cherche à analyser les fonctions des cellules végétales à l’aide d’approches multidisciplinaires incluant la biochimie, la biologie cellulaire et moléculaire, mais aussi des études physiologiques et génétiques. Les projets du laboratoire s’articulent autour de 4 axes de recherche avec des intérêts transversaux:
(1) Comprendre, au niveau moléculaire (de la physiologie et l’enzymologie jusqu’à la structure 3D des enzymes), les étapes de la synthèse des vitamines [B9 (folate), H (biotine), E (tocophérols)] et des acides aminés essentiels (aromatiques et ceux dérivés de l’aspartate).
(2) Comprendre le rôle des protéines de l’enveloppe des plastes (de plantes ou de parasites apicomplexes) dans des processus incluant transports, biogenèse, signalisation et relation avec la dynamique membranaire de la cellule entière (en particulier chez les parasites apicomplexes).
(3) Analyser l’impact de stress (en particulier induits par les métaux lourds) sur le fonctionnement de la cellule végétale et identifier les mécanismes biochimiques et biophysiques de défense adoptés par les plantes pour lutter contre ces stress.
(4) Comprendre les relations structure-function de macromolécules biologiques et complexes macromoléculaires (en particulier les microtubules et les filaments d’actine du cytosquelette des plantes et les complexes impliqués dans la mise à fleur).