Dynamique des protéomes cellulaires
Le protéome est dynamique : il peut être modifié, voire profondément remodelé. L'étude de la dynamique du protéome fournit des informations extrêmement précieuses puisqu'elle permet d'appréhender, au niveau moléculaire, les grands mécanismes cellulaires : division, différenciation,…
Biomarqueurs : Identification et quantification de marqueurs de pathologies dans les fluides biologiques
En santé humaine, la comparaison du protéome d'un tissu sain avec celui d'un tissu malade peut permettre de repérer, parmi l'ensemble des protéines identifiées, celles qui présentent des différences d'abondance importantes. Parmi ces protéines, certaines sont susceptibles de constituer des marqueurs de la maladie.
DECanBio.
Annotation des génomes
L'annotation du génome d'un organisme conduit à combiner l'ensemble des informations pertinentes qui permettront d'appréhender, au niveau moléculaire, les mécanismes biologiques mis en jeu chez cet organisme. Les stratégies actuelles d'annotation syntaxique d'un génome reposent soit sur la seule connaissance de sa séquence nucléotidique (méthodes de prédiction dites ab initio), soit sur des résultats d'analyse de transcrits. En collaboration avec l'INRIA Rhône-Alpes, nous développons des outils informatiques et des stratégies qui nous permettent d'utiliser la protéomique comme un outil d'annotation des génomes.
PepLine.
EDyP-Recherche
 Axes thématiques de recherche |
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Spectrométrie de masse à transformée de Fourier (FTMS) : la FTMS permet l'analyse protéomique à haut débit d'échantillons biologiques complexes (plasma, urine, ...)
Équipe AMT. Caractérisation et Quantification des Modifications Post-Traductionnelles des protéines Équipe PTM/SRM. Quantification Absolue par production de protéines isotopiquement alourdies Équipe PSAQ. Informatique/Bioinformatique : Développement d'outils pour la gestion et l'analyse des données issues des analyses par spectrométrie de masse Équipe Info. Plate-forme protéomique : Le plateau d'analyse protéomique du CEA a été conçu pour mettre à la disposition de la communauté scientifique un ensemble de technologies destinées à la microanalyse des protéines par spectrométrie de masse Équipe EDyP-Service. |