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Laboratoire Biochimie et Biophysique des systèmes Intégrés (BBSI)

UMR 5092 CEA-CNRS-Université Joseph Fourier Grenoble 1




Directeur
 
François Boulay
iRTSV/LBBSI
17 rue des Martyrs
38 054 Grenoble cedex 9
France

Secrétariat :
Tel. : (33) 4 38 78 45 79
Fax : (33) 4 38 78 44 99
 
Introduction
 
Le laboratoire est composé de cinq groupes répartis en quatre équipes qui travaillent sur l'élucidation des mécanismes moléculaires par lesquels les bactéries et les cellules eucaryotes s'adaptent et intègrent des signaux de stress variés.

Plusieurs types de signaux de stress sont étudiés :

1) signaux de contact entre une bactérie pathogène (modèle Pseudomonas aeruginosa) et la cellule-cible aboutissant à l'induction de la transcription des gènes du système de sécrétion de type III (SST3). L'injection des exotoxines bactériennes par le SST3 dans la cellule-cible conduit à l'altération des voies de signalisation intracellulaire ;

2) signaux chimiotactiques émanant du catabolisme de protéines bactériennes ou mitochondriales et qui mènent, par l'intermédiaire de récepteurs de surface, à l'activation des cellules effectrices de l'immunité innée (neutrophiles, monocytes, macrophages et cellules dendritiques) ;

3) signaux de différenciation qui modifient de manière sélective le profil du protéome de sécrétion des cellules myéloïdes (cellules dendritiques, macrophages) ;

4) signaux de stress nutritionnel qui modulent la signalisation intracellulaire par endocytose de récepteurs chez l'amibe Dictyostelium discoideum, en particulier lors du programme de différenciation et de morphogenèse ;

5) divers signaux de stress qui aboutissent, au niveau de la mitochondrie, à la formation d'un pore de perméabilité transitoire comprenant le transporteur mitochondrial ADP/ATP et des protéines partenaires comme la porine ou la cyclophiline D.

Les recherches développées dans le laboratoire s'appuient sur des approches pluridisciplinaires aux interfaces avec la biochimie, la chimie, la biophysique, la biologie cellulaire et se rejoignent sur des problèmes fondamentaux de biologie cellulaire. L'objectif des études menées par les équipes est de comprendre au niveau moléculaire, le fonctionnement des voies de signalisation intracellulaire, de décrypter les mécanismes sous-jacents à leurs régulations ou ceux qui en perturbent le fonctionnement normal. Une attention particulière est portée sur la biochimie des protéines membranaires et des complexes protéiques qui y sont associés. Ces protéines membranaires englobent les récepteurs de la membrane plasmique ou ceux associés aux vésicules d'endocytose, le transporteur mitochondrial ADP/ATP et le pore de perméabilité transitoire, les protéines bactériennes qui s'insèrent dans la membrane de la cellule-cible ainsi que le protéome des compartiments membranaires au cours de la différenciation.

 
Thématiques de recherche
 

• Infection et réponses cellulaires (modèles : Pseudomonas aeruginosa et cellules myéloïdes)

Protéomique et biologie cellulaire : différenciation des cellules myéloïdes (modèles : macrophages et cellules dendritiques)

Signalisation et endocytose de récepteurs (modèle Dictyostelium discoideum)

• Le transporteur mitochondrial d'adénine nucléotide di-, tri-phosphates : aspects structuraux et fonctionnels. Implications dans des mécanismes apoptotiques. (modèles : cœur de bœuf, levure Saccharomyces cerevisiae)

 
Techniques utilisées
 
Clonage et séquençage de gènes, Mutagenèse dirigée, Marquage froid et radioactif d'ADN, PCR, Empreinte à la DNaseI, Gels retard, Génétique des bactéries, transfection de cellules eucaryotes, Analyse protéomique, Technique du double-hybride, Microscopie par immunofluorescence, tri cellulaire, Marquage métabolique, Enzymologie, Production de protéines recombinantes : système levure, Purification de protéines hydrophiles, membranaires hydrophobes et de polypeptides, Fluorimétrie (mesure du calcium intracellulaire, fluorescence intrinsèque), HPLC, Spectroscopie (UV-visible, RMN), Synthèses chimiques (détergents, ligands spécifiques fluorescents ou photoactivables radiomarqués), Marquage de protéines par sondes photoactivables, Western blot, Invalidation de gène, Knock-down par siRNA, Reconstitution en protéoliposomes